Scytosiphon lomentaria está formada por talos no ramificados, cilíndricos, tubulares y huecos que nacen de una base discoídea común, se caracteriza por poseer a lo largo del talo constricciones y se agudiza hacia el ápice. Llega a medir hasta 36 cm de largo. En un corte transversal del talo tubular se pueden observar dos capas de células cuboídeas pigmentadas  que miden entre 10-12 µm y una médula incolora que mide entre 40-50 µm.